Der Portgerensee liegt auf der Alp Portgeren in der Urner Gemeinde Andermatt (UR). Er befindet sich westlich des Pass Maighels, wo die Grenze zum Kanton Graubünden liegt. Die Höhe des Bergsees beträgt 2383 Meter über Meer und er ist rund 150m lang und ebenso breit.