Der Obersee liegt im Erstfeldertal auf dem Gebiet der Gemeinde Erstfeld im Kanton Uri. Der Bergsee befindet sich auf einer Höhe von 1904 Metern über Meer.
Nördlich des Sees circa zwei Kilometer entfernt liegt der Fulensee. Beide Seen werden vom Fulbach gewässert und entwässert. Zwischen den Seen und nördlich des Obersees liegt die bekannte Kröntenhütte des SAC.
