Der Klöntalersee liegt im Klöntal im Kanton Glarus. Der Natursee liegt auf einer Höhe von 848 Metern über Meer oberhalb der Gemeinde Glarus. Mit einer Länge von circa fünf Kilometern und einer durchschnittlichen Breite von mehr als 200 Metern ist er einer der grössten Glarner Seen. Seit Beginn des 20. Jahrhunderts (1908) wird der Klöntalersee auf seiner Ostseite durch einen kleinen Staudamm aufgestaut und zur Energiegewinnung genutzt.
Gespiesen wird der Stausee vom Fluss Klön (Glarner Dialekt: Chlü) und einigen kleineren Bergbächen. Der Löntsch wiederum fliesst aus dem See talwärts und mündet bei Netstal in die Linth.